Международная группа исследователей из клиники Шарите в Берлине представила новый программный инструмент под названием ovrlpy, который значительно улучшает контроль качества в области пространственной транскриптомики — важного метода биомедицины. Эта технология позволяет визуализировать активность клеток, определяя функционирование определённых генов в конкретных участках ткани. Однако анализ традиционно проводился в двух измерениях, игнорируя сложную трёхмерную структуру образцов. Из-за этого могли возникать ошибки в интерпретации данных, когда активность клеток ошибочно приписывалась другим клеткам.
Программа ovrlpy способна проводить трёхмерный анализ распределения РНК-сигналов, выявляя места наложения клеток и ткани. Это увеличение точности анализа позволяет получать более надёжные результаты в исследовании структуры тканей. Как отмечает доктор Навид Ишак, данный инструмент закладывает основу для более корректных результатов в таких областях, как онкология и нейронаука. В последние годы пространственная транскриптомика, признанная «Методом года» в 2020 году, активно внедряется в практику, что требует дальнейшего повышения качества данных и их анализа.